Electroforesis

¿Qué es la electroforesis?

La electroforesis es una técnica de laboratorio para separar moléculas cargadas, como ADN, ARN o proteínas, según su tamaño y carga eléctrica, utilizando un campo eléctrico y un medio poroso (gel) que actúa como un tamiz.

¿Cómo funciona?

  1. Se coloca la muestra en un gel poroso (agarosa o poliacrilamida).
  2. Se aplica una corriente eléctrica:
  • Las moléculas negativas migran hacia el ánodo (+) y las positivas hacia el cátodo (-). 
  • Las moléculas más pequeñas migran más rápido a través del gel.

Esto permite separar y visualizar fragmentos de ADN, ARN o proteínas, lo cual es esencial para análisis moleculares y diagnósticos.

Imagen 1. Zonas de aplicación en gel de agarosa. Imagen obtenida de https://genotipia.com/electroforesis/

Tipos de Electroforesis Relevantes

  • Electroforesis en gel de agarosa – Ideal para separar moléculas grandes como el ADN.
  • Gel de poliacrilamida – Mayor resolución para moléculas más pequeñas (proteínas), aunque requiere manejo cuidadoso.
  • Electroforesis capilar – Muy eficiente, requiere menos muestra y reactivos, con resultados digitales.
  • Isoelectroenfoque y bidimensional – Permiten separación con alta resolución, útil en análisis proteómico avanzado.

Principales Aplicaciones en la Ciencia y en la Medicina

En Genética y Biología Molecular

• Genotipado y análisis de variaciones genéticas – Determina variantes de genes específicos comparando migraciones con marcadores de peso molecular estándar.

• Diagnóstico de enfermedades genéticas – Identificación de expansiones genéticas (por ejemplo, en enfermedades por trinucleótidos).

• Oncología molecular – Monitorización de “inestabilidad de microsatélites” en tumores, marcadores clave en cáncer.

En Investigación y Desarrollo

• Verificación de productos de PCR y secuenciación – Comprobación de resultados de amplificación antes de secuenciar o clonar.

• Proteómica y análisis de proteínas – Caracterización de perfiles de expresión proteica, evaluación de pureza y detección de biomarcadores.

Diagnóstico Clínico y Salud

• Perfil de proteínas séricas o hemoglobinas para diagnóstico de enfermedades hematológicas (como anemia falciforme, talasemias).

• Evaluación de biomarcadores en infecciones y condiciones metabólicas.

Ciencias Forenses y de Paternidad

La electroforesis es una herramienta esencial para identificar perfiles de ADN, compararlos con bases de datos y resolver casos forenses o determinar parentesco.

Ejemplo Práctico: análisis de variantes en el gen PER3

Paso 1: extracción y preparación de la muestra de ADN

El análisis de variantes genéticas mediante electroforesis comienza con un paso crítico: la extracción y correcta preparación del ADN. En el caso del gen PER3, un gen asociado a los ritmos circadianos y patrones de sueño, la calidad del ADN obtenido es determinante para asegurar resultados confiables en las etapas posteriores del análisis molecular.

Paso 2: Amplificación Mediante PCR y tinción de muestra

En esta etapa se emplea la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar específicamente el fragmento del gen PER3 de interés. Este procedimiento permite obtener millones de copias del ADN objetivo a partir de una cantidad inicial mínima, asegurando una señal detectable y reproducible en los análisis posteriores.

La correcta selección de buffers, dNTPs, cebadores, enzimas y condiciones de reacción es clave para lograr una amplificación eficiente y específica, reduciendo la aparición de productos inespecíficos.

Paso 3: Electroforesis y análisis de variantes genéticas

Una vez amplificado el ADN, los productos de PCR se analizan mediante electroforesis en gel, técnica que permite separar los fragmentos según su tamaño y visualizar las diferencias entre muestras. A partir de los patrones de migración obtenidos, es posible identificar variantes genéticas, comparar individuos y validar los resultados de la amplificación.

Se lleva de la siguiente manera:

• Preparación del gel de electroforesis

Se prepara un gel de agarosa con la concentración adecuada según el tamaño esperado del fragmento del gen PER3. La correcta formulación del gel es clave para obtener una buena resolución y separación de las bandas de ADN.

• Uso de buffers de corrida (TAE / TBE)

Los buffers garantizan la conductividad eléctrica y la estabilidad del pH durante la electroforesis, evitando distorsiones en la migración del ADN y asegurando resultados reproducibles.

• Carga de las muestras y aplicación del campo eléctrico

Los productos de PCR se depositan en los pocillos del gel junto con un marcador de peso molecular. Al aplicar el campo eléctrico, los fragmentos de ADN migran a través del gel en función de su tamaño.

• Separación y resolución de los fragmentos de ADN

La electroforesis permite separar los fragmentos amplificados, facilitando la observación de diferencias en el tamaño del ADN entre distintas muestras analizadas.

• Visualización de las bandas de ADN

Una vez finalizada la corrida, el ADN se visualiza mediante colorantes específicos y sistemas de iluminación adecuados, permitiendo observar bandas definidas y bien contrastadas.

• Comparación con el marcador de peso molecular

La posición de las bandas se compara con el marcador para confirmar el tamaño del fragmento amplificado del gen PER3 y detectar posibles variaciones.

• Identificación de variantes genéticas

Las diferencias en el patrón de migración permiten identificar inserciones, deleciones o polimorfismos asociados al gen PER3 entre distintas muestras.

• Análisis comparativo entre individuos o grupos

Los resultados obtenidos se comparan entre muestras para evaluar variabilidad genética, estudios poblacionales o asociaciones con características biológicas específicas.

• Control de calidad del proceso

La electroforesis actúa como una herramienta de verificación del proceso completo, permitiendo evaluar la calidad del ADN, la eficiencia de la PCR y la confiabilidad de los reactivos utilizados.

• Relación con productos y consumibles de laboratorio

Este paso requiere el uso de geles de agarosa, buffers de electroforesis, marcadores de peso molecular, colorantes, cámaras de electroforesis y sistemas de documentación, todos fundamentales para obtener resultados claros y reproducibles.

Imagen 2: cubeta de electroforesis. Imagen obtenida de: https://genotipia.com/electroforesis/

Paso 4: Análisis de resultados:

Una vez completada la migración en el gel y detenida la corrida, lo que vemos son bandas separadas que representan fragmentos de ADN/ARN o proteínas según el tipo de electroforesis que hayas realizado. Estas bandas se visualizan porque las moléculas se han teñido con un agente que permite verlas bajo luz (por ejemplo, con bromuro de etidio o colorantes seguros alternativos). 

¿Qué significan las bandas? 

Posición en el gel: La distancia que recorre cada banda depende del tamaño y la carga de las moléculas. Los fragmentos más pequeños migran más lejos que los más grandes.

Comparación con un marcador: Colocar un marcador de peso molecular (o escalera) te permite estimar el tamaño de tus fragmentos comparando la ubicación de tus bandas con la de los estándares conocidos.

Número de bandas:

Una sola banda puede indicar un único fragmento presente o que no hay variación en la muestra.

Varias bandas sugieren que hay más de un fragmento o diferentes variantes en la muestra.

Intensidad de la banda: Cuanto más intensa o más gruesa sea la banda, mayor cantidad de esa molécula está presente.

Obtenido de: Genotipia. (s. f.). Electroforesis: qué es y para qué sirve. https://genotipia.com/electroforesis/

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